“工程优势学科创新平台”项目高校从属于“工程”但不属于“工程”的部属高校中选择，简称“特色工程”，这些大学基本上是没有经历过合并重组的行业特色型大学，学科精度极高，拥有一至两个全国顶尖的学科，在行业内认可度极高，具有深厚的行业底蕴和学科积淀。
医药类：
北京中医药大学：中医药优势学科创新平台
北京中医药大学年9月，入选国家首批“双一流”世界一流学科建设高校；年12月，学校成为创建世界一流中医药大学合作联盟创始成员；年，学校成为“工程优势学科创新平台”建设高校；年，学校成为国家“工程”重点建设高校；年9月，学校被确定为六十四所全国重点大学之一。
始建于年，前身为北京中医学院，是国务院批准最早创办的高等中医药院校；年，学校与中国中医研究院合并；年，两院分开，分别恢复独立办学；年，学校更名为北京中医药大学；年，学校与北京针灸骨伤学院合并，组建新的北京中医药大学。
“优势学科创新平台”：中医药；世界一流建设学科：中医学、中西医结合、中药学。
在教育部第四轮学科评估中，最高评级为A+级，中医学(全国第四轮学科评估，与上海中医药大学并列第一)、中西医结合(全国第四轮学科评估，与上海中医药大学并列第一)；B+级，中药学。
中国药科大学：新药发现理论与技术优势学科创新平台
中国药科大学年9月，学校入选国家首批“双一流”世界一流学科建设高校名单；年，学校入选“工程优势学科创新平台”项目；年，学校进入首批国家“工程”重点建设高校行列。
坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的古都南京。始建于年，原名国立药学专科学校（本科四年制），是我国历史上第一所由国家创办的药学高等学府。年迁往汉口，年迁往重庆，年回迁南京。年更名为华东药学专科学校。年，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入学校，成立华东药学院。年，中南卫生专科学校药剂专修科并入学校。年更名为南京药学院。年与筹建中的南京中药学院合并，成立中国药科大学。年，江苏省药科学校并入学校。
“优势学科创新平台”：新药发现理论与技术；世界一流建设学科：中药学。
在全国第四轮学科评估中，最高评级为A+级，药学(全国第四轮学科评估，与北京协和医学院并列第一)；B+级,中药学；C+级，中西医结合；C-级，工商管理。
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